Идея создания в Новосибирске памятника жертвам политических репрессий принадлежит председателю Новосибирского общества «Мемориал» Леониду Соломоновичу Трусу. Ещё в середине 80-х годов он обратился в администрацию райисполкома Железнодорожного района Новосибирска с предложением о создании памятника. 

Леонид Соломонович Трус – председатель Новосибирского общества «Мемориал», кандидат географических наук, преподаватель Новосибирского государственного университета. В 1952 году, будучи студентом энергофакультета Уральского политехнического института (УПИ), был арестован и осужден по обвинению в подготовке террористического акта по отношению к «одному из руководителей Партии и Правительства». Приговор: 19-58.8, 58.10 – расстрел с заменой 25-ю годами лагерей и 5-ю годами поражения в правах. На каторжных работах потерял ногу, в 1956 году был освобожден со снятием судимости, восстановился в университете. В 1960 году переехал в Академгородок, работал в ИЯФе и Институте экономики. С 1988 года – участник движения «Мемориал».

Тогда же было определено место для установки  - Нарымский сквер и назначен архитектор – Александр Бернов.  Было принято решение, что достойным символом может стать камень с каменоломен в п. Ложок Искитимского района.

В поселке Ложок (в 9 км к юго-востоку от Искитима) находились особый лагерный пункт №4 (ОЛП-4) и №2 (ОЛП-2) Сиблага. Лагерь ОЛП-4 считался штрафным и был известен среди заключенных под названием Искитимского. ОЛП-2 входил в КУИТУ — Краевое управление исправительных учреждений. Среди заключенных Сиблага было много известных людей, в частности Наталья Ларина — жена Николая Бухарина.

30 октября 1994 года, в день памяти жертв политических репрессий, на месте лагеря открыт памятник «Поклонный крест». Крест отлит из чугуна. Высота — 2 м 20 см. Размах средней крестовины — 1 м. С фасадной части постамента на мраморной плите надпись: «Жертвам политических репрессий. Мир праху, честь имени невинно погибших».

Сам камень был выбран репрессированными обитателями лагеря, совместно с А. Берновым. В камень была вмонтирована памятная таблица и до принятия окончательного архитектурного решения он был установлен на временное место в северном углу Нарымского сквера (примерно в 70 метрах от нынешнего расположения монумента). Здесь он простоял более 10 лет.

Уже в начале 2000-х годов архитекторы В.М. Пивкин и А.А. Гамалей предложили архитектурное решение — постамент и ротонда из полированного серого гранита высотой 4,5 м , надпись на черной мраморной доске  — «Граждане Новосибирска — жертвам политических репрессий». На постаменте высечены названия самых крупных лагерей ГУЛАГа.

Торжественное открытие памятника состоялось 30 октября 2003 года, в «День политзаключенных».

До 1974 года в качестве Дня политзаключенных отмечалась другая дата — 5 сентября, годовщина декрета 1918 года «О красном терроре», который ввел в Советской России практику концентрационных лагерей. 30 октября 1972 года в мордовском лагере умер Юрий Галансков, получивший срок за создание «Белой Книги» о нарушениях прав человека в СССР, а также за свой протест против лишения свободы Андрея Синявского и Юлия Даниэля — писателей, осужденных за публикацию рассказов на Западе. Через два года, в октябре 1974 года группа соузников господина Галанскова сумела передать на волю предложение отмечать во всем мире этот день как День политзаключенных. В 1999 году эту дату своим указом утвердил президент РФ Борис Ельцин.